Markaz Al-Qur`an dan Bahasa Arab (MQBA) Isy Karima yang dibentuk pada tahun 2014 adalah Unit pendidikan di bawah naungan YSPII (Yayasan Sosial dan Pendidikan Islam Isy Karima) yang secara intensif berkonsentrasi pada bidang pendidikan Tahfizhul Qur`an dan Bahasa Arab.

MQBA Isy Karima diselenggarakan bagi seluruh lapisan masyarakat dengan batas umur minimal 13 tahun (lulusan SD/sederajat) yang ingin menghafal Al-Qur`an dan mempelajari Bahasa Arab. MQBA Isy Karima diharapkan menjadi inti pendidikan MTQ Isy Karima, yaitu Al Qur’an sebagai sumber ilmu orang-orang yang terdahulu dan yang akan datang serta Bahasa Arab sebagai kunci untuk memahaminya.

Saat ini, MQBA Isy Karima menyelenggarakan dua pilihan program, yaitu program I’DAD dan program WUSTHA. Program I’DAD MQBA Putra dan Putri merupakan program yang berfokus pada pendampingan tes masuk unit-unit pendidikan formal MTQ Isy Karima. Program I’DAD juga diperuntukkan bagi yang ingin fokus menghafal dan mempelajari Bahasa Arab dalam 1 tahun. Adapun program WUSTHA (setara SMP, khusus putra) merupakan kerjasama antara MQBA Isy Karima dengan IMSHI (IMTAQ Shighar) Isy Karima yang berfokus pada Tahfizhul Qur’an, pengajaran Bahasa Arab berbasis qira’atul kutub, dan pendidikan adab dengan masa pendidikan tiga tahun. Program WUSTHA setara pendidikan level SMP/sederajat dengan penyelenggaraan ujian kesetaraan.

Terbentuknya kader huffazh yang memahami Bahasa arab dan berakhlaqul karimah

1. Menyelenggarakan Program Tahfizhul Qur`an
2. Menyelenggarakan Program Pendidikan Bahasa Arab secara intensif
3. Menyelenggarakan Program Tarbiyah Khuluqiyyah