Jauh sebelum berdirinya Ma'had Tahfizhul Qur'an Isy Karima, terbentuklah di tahun 1994 Yayasan Sosial dan Pendidikan Islam (YSPI) Isy Karima dengan beberapa program, seperti Bimbingan Da'i Islam, Baitul Maal Wat Tamwil dan Kursus Menjahit untuk masyarakat wilayah Surakarta. Di bawah bimbingan Ust. Ya'qub Basya Rahimahullah, Ust. Ahmad Husnan, Lc Rahimahullah, Ust. Muhammad Ilyas, Lc hafizhahullah, dan Ust. Suwardi Efendi, Lc rahimahullah.
.Kiprah YSPI Isy Karima terus berlanjut dengan membangun sebuah masjid di dusun Pakel, desa Gerdu, kecamatan Karangpandan sebagai benteng ummat dari misi kristenisasi dan pemurtadan, diberilah nama masjid tersebut "Bilal bin Rabbah" dibangun di atas tanah wakaf dr. Tundjung Soelaksono Soeharso, Sp.OT rahimahullah bekerjasama dengan Ust. Muzayyin Abdul Wahhab, Lc rahimahullah perwakilan dari Dewan Dakwah Islamiyah Indonesia (DDII) pusat Jakarta. Adapun di antara program-programnya adalah dengan mendirikan Taman Pendidikan Al-Qur'an (TPA) untuk anak-anak dan kajian ibu-ibu serta menghidupkan shalat jum'at bekerjasama dengan KUA Karangpandan di tahun 1996 ketua takmir pertama bapak Drs. Sunarno dari Boyolali..
.Berawal dari kuatnya tekad untuk memberikan manfaat yang luas kepada ummat serta membentenginya dari misi pemurtadan. Dr. Tundjung Soelaksono Soeharso menyampaikan kepada pihak penasihat YSPI Isy Karima ingin mendirikan sebuah pesantren. Maka, asatidzah penasihat YSPI Isy Karima setelah bermusyawarah dan memohon arahan dari para Pengurus DDII perwakilan Jawa Tengah mengusulkan untuk mendirikan sebuah program pendidikan pesantren berbasis tahfizhul Qur'an. Maka diutuslah KH. Wahyuddin rahimahullah dan Ust. Aris Munandar, Lc rahimahullah untuk mencari figur muhafizh robbani yang akan membidani lahirnya pesantren tersebut. Sampailah tim tersebut ke Pondok Pesantren Muhammadiyah Karangasem Paciran Lamongan dan bertemu dengan KH. Abdurrahman Syamsuri rahimahullah dan beliau mengutus salah satu santri terbaiknya Ust. Syihabuddin Abdul Mu'iz..
.Berdirilah pada tahun 1998 Ma'had Tahfizhul Qur'an Isy Karima Karanganyar, dengan Mudir pertama KH. Wahyuddin dan Mas'ul Tahfizh pertama Ust. Syihabuddin Abdul Mu'iz dengan program tunggal Ma'had 'Aly Tahfizhul Qur'an (MALTIQ) Isy Karima program pendidikan setingkat Diploma II masa pendidikan 2 tahun, dengan jumlah angkatan pertama sebanyak 16 orang beasiswa full, utusan dari berbagai pondok pesantren yang tergabung dalam BKSPPI, mereka diwajibkan untuk mengkhatamkan al-Qur'an 30 Juz dan ilmu-ilmu syar’i lain, alhamdulillah dengan pengorbanan dan kesungguhan mereka dan bimbingan dari Ust. Syihabuddin Abdul Mu'iz, MTQ Isy Karima di tahun 2000 berhasil mewisuda angkatan pertamanya..
.Untuk meningkatkan kualitas Qur'an baik secara riwayah maupun diroyah, Ust. Syihabuddin Abdul Mu'iz di tahun 2001 berangkat untuk bertalaqqi kepada Masyayikh Qurro' yang ada di Biladisy Syam, Suriah tepatnya. Dan beliau menyelesaikan sanad Qur'annya (bersambung dari guru beliau kepada Rasulullah g) selama dua tahun dan hingga saat ini menjadi pimpinan Dewan Pengasuh dan Kyai di Ma’had Tahfizhul Qur’an Isy Karima..
.Upaya untuk turut serta meningkatkan kualitas pendidikan di Indonesia tidak berhenti sampai di sini, pengurus MTQ Isy Karima atas restu YSPI Isy Karima, di tahun 2000 ini juga mendirikan Madrasah Aliyah Tahfizhul Qur’an Program Khusus (MATIQ-PK) Isy Karima (setingkat SMA) masa pendidikan 4 tahun dengan ustadz H. Eman Badru Tamam, Lc sebagai kepala sekolah pertamanya. Saat ini menjadi MATIQ Program IPA dengan kelas Khusus dan Regulernya.
.Alhamdulillah saat ini terus berkembang dari Kelompok Bermain dan Raudhatul Athfal (KB-RA) Karima Ulya (berdiri di tahun 2007), Madrasah Ibtidaiyyah Tahfizhul Qur’an (MIT) Isy Karima setingkat SD tahun 2010, di tahun yang sama berdiri pula, Sekolah Tinggi Ilmu Al-Qur’an dengan program studi Ilmu Al-Qur’an dan Tafsir..
.Karya terus berlanjut, di tahun 2012 berdiri pula unit I’dadul Mu’allimin Tahfizhul Qur’an (IMTAQ) Isy Karima setingkat SMA Program Keagamaan, dan Islamic Center I’dadud Du’at (ICID) Isy Karima didedikasikan untuk turut serta meningkatkan kualitas pemuda, imam masjid dan takmir-takmir masjid di kabupaten Karanganyar..
.Kemudian berdirilah Markaz Qur’an dan Bahasa Arab (MQBA) Isy Karima (2013) untuk persiapan dan penguatan Al-Qur’an dan Bahasa Arab. Di tahun 2018 berdirilah I’dadul Mu’allimin Tahfizhul Qur’an Shighor (IMTAQ Shighor) Isy Karima, pendidikan setingkat SMP, semua unit pendidikan ini berbasis menghafal Qur'an sesuai dengan tingkatannya dan tersedia untuk putra maupun putri..
.Demikianlah perjalanan singkat MTQ Isy Karima, diawali dari niat berkhidmah memberikan manfaat kepada ummat sekaligus mendukung program pemerintah wajib belajar 9 tahun. Tentu saja tidak ada yang sempurna, perjuangan ini tidak akan berhenti sampai disini, masih banyak cita-cita mulia yang ingin diwujudkan demi kemuliaan Islam dan kaum Muslimin..
.Semoga Allah d senantiasa memberikan kemudahan dan kelancaran kepada hambaNya yang terus berusaha untuk mendapatkan ridhaNya. Amiin Yaa Rabbal Alamiin