IMTAQ Shighor Program Unggulan adalah unit Setingkat SMP yang menitikberatkan pada pembelajaran Tahfizhul Qur’an dan bahasa arab serta pembentukan akhlakul karimah. Dengan target hafalan adalah 30 juz dalam 3 tahun masa pendidikan dan pembelajaran bahasa arab secara intensif serta dasar-dasar ilmu syar’i. Di samping itu juga santri dibekali dengan materi umum untuk bisa mengikuti Ujian Nasional. Dengan harapan lulusan Imtaq Shighor Isy Karima Program Unggulan adalah Hafizh/Hafizhoh yang memiliki kemampuan berbahasa arab dengan baik serta bisa melanjutkan ke jenjang pendidikan yang lebih tinggi.

Terbentuknya hafizh & hafizhah yang memiliki dasar-dasar ilmu syar’i, berbahasa arab fashih dan berakhlaq Islami

1. Menyelenggarakan program Tahfizhul Quran 30 Juz
2. Menyelenggarakan pendidikan bahasa arab secara intensif
3. Menyelenggarakan pendidikan berbasis ilmu syar’i
4. Menyelenggarakan program tarbiyah khuluqiyah.

Sistem pendidikan yang diterapkan di IMTAQ Shighor Program Unggulan adalah Formal dan non Formal.

Sistem pendidikan Formal adalah dengan menggunakan sistem klasikal dan sistem talaqqi. Sistem klasikal diselenggarakan selama 6 hari dalam sepekan. Dalam hal ini santri mengikuti kegiatan belajar mengajar di kelas mulai pukul 08.00 – 11.30 WIB, diselingi istirahat. Sedangkan sistem talaqqi, digunakan untuk kegiatan tasmi’ Al-Qur’an yang dimulai Ba’da Subuh – 06.15, dan ba’da ashar – 16.45. Kegiatan ini juga dilakukan selama 6 hari dalam sepekan.

Adapun pendidikan non formal adalah pendidikan yang diselenggarakan di luar jam kelas dengan maksud untuk menjaga keseimbangan antara aspek keilmuan dan aspek amaliyah (praktek) yang menjadi ciri khas pesantren. Melalui kegiatan ini, diharapkan ilmu yang diperoleh didalam kelas dapat langsung diaplikasikan dalam kehidupan sehari-hari. Selain untuk mempraktekkan serta mengamalkan ilmu, juga dapat untuk menambah dan menguatkan ilmu santri.

Di antara jenis kegiatan non formal yang ada di IMTAQ Shighor Program Unggulan adalah:

1. Kajian ilmiah (dars ‘aam) berupa kajian kitab yang diikuti oleh seluruh santri. Muhadhoroh (ilqo’ kalimat) dan Idharul
2. Maharoh Lughowiyah, sebagai wadah latihan untuk keterampilan pidato atau orasi serta drama bahasa arab.
3. Tasmi’ Al Qur’an Bulanan, Sebagai media pembiasaan untuk khataman qur’an di masjid-masjid desa sekitar pesantren
4. SAPALA (Santri Pencinta Alam), sebagai wadah untuk melatih kedisiplinan santri
5. Bela diri
6. Berkuda, Memanah, dan Berenang
7. Tata Boga Santriwati
8. Dauroh Ilmiyah
9. Amal Jama’i (kerja bakti bersih-bersih area Mahad)

Bahasa Arab	Tajwid	Akhlaq/Adab	Matematika
Khot	Hadits	Tahsin

Bahasa Arab	Tajwid	Shorof	Fiqh
Siroh	Aqidah	Fiqh	Matematika
Akhlaq/Adab	Tahsin	Bahasa Inggris

Bahasa Arab	Bahasa Inggris	Nahwu	Fiqh
Siroh	Aqidah	IPA	Matematika
Akhlaq/Adab	Tahsin	Shorof	Bahasa Indonesia

Kelas	Target	Juz
1	11	JUz 30, Juz 1-10
2	12	Juz 12 sd Juz 22
3	7	Juz 23 sd Juz 29